Das Bezahlen funktioniert einfach: Am Geldautomaten Guthaben aufladen und bei registrierten girogo-Partnern Karte zum Bezahlen dicht an das Terminal halten. Der Betrag wird vom Prepaid-Guthaben abgebucht. PIN-Eingabe oder Unterschrift sind nicht nötig. SparkassenCards mit girogo-Funktion können sogar direkt beim Bezahlen mit Guthaben geladen werden – entweder mittels PIN-Eingabe oder maximal einmal täglich mit der Funktion Abo-Laden.
Das Bezahlen mit girogo entspricht dabei den hohen Sicherheitsstandards der Deutschen Kreditwirtschaft. Zahlungen können nur an ein vorab vereinbartes Konto eines registrierten Händlers geleistet werden. Dank des Prepaid-Systems wird beim Bezahlen zudem nicht auf das Konto des Kunden zugegriffen, sondern nur auf das vorausbezahlte Guthaben (maximal 200 Euro). Alle Daten, die für die Transaktion benötigt werden, werden auf Basis internationaler Sicherheitsvorgaben verschlüsselt an das Händlerterminal übertragen.